{"id":21060963,"date":"2022-02-22T10:44:50","date_gmt":"2022-02-22T09:44:50","guid":{"rendered":"https:\/\/geek.hr\/znanost\/?p=21060963"},"modified":"2022-02-22T16:02:59","modified_gmt":"2022-02-22T15:02:59","slug":"znanstvenici-su-napravili-3d-strukturu-proteina-koji-pomaze-u-popravku-dna","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/geek.hr\/znanost\/clanak\/znanstvenici-su-napravili-3d-strukturu-proteina-koji-pomaze-u-popravku-dna\/","title":{"rendered":"Znanstvenici su napravili 3D strukturu proteina koji poma\u017ee u popravku DNA"},"content":{"rendered":"\n<p>Znanstvenici su analizirali trodimenzionalnu strukturu proteina koji ina\u010de sprje\u010dava razvoj kolorektalne polipoze. Gen koji kodira taj protein se naziva MUTYH. Mutacija tog gena uzrokuje nasljednu kolorektalnu polipozu, \u0161to dovodi do<a href=\"https:\/\/geek.hr\/znanost\/clanak\/rak-debelog-crijeva-sve-cesci-kod-mladih-osoba\/\"> razvoja kolorektalnog karcinoma<\/a>.<\/p>\n\n\n\n<p>Kako nastaju mutacije? Unutar stanice nastaju reaktivne vrste kisika koje uzrokuju oksidaciju DNA. DNA se sastoji od baza, a kada jedna od njih, gvanin, bude oksidirana, nastaje 8-oksogvanin. U normalnim okolnostima, gvanin se spaja s citozinom, ali novonastali 8-oksogvanin se mo\u017ee spojiti i s adeninom, te na taj na\u010din uzrokovati mutacije koje mogu dovesti do raka i drugih bolesti povezane sa starenjem.<\/p>\n\n\n\n<p>Tu u funkciju dolazi MUTYH, to\u010dnije, njegov protein. Taj protein pronalazi i uklanja adenin koji je pogre\u0161no sparen s 8-oksogvaninom. Kada do\u0111e do mutacije gena MUTYH, nastaje protein koji vi\u0161e ne mo\u017ee vr\u0161iti svoju ulogu te adenin ostaje sparen s 8-oksogvaninom i pove\u0107ava se rizik od pojave raka. Tako\u0111er je zamije\u0107eno da se u\u010dinkovitost popravljanja pove\u0107ava kada MUTYH stupi u interakciju s PCNA (proteinom uklju\u010denim u replikaciju DNA). Mehanizam na koji na\u010din se pobolj\u0161ava u\u010dinkovitost popravka nije poznat.<\/p>\n\n\n\n<h2 class=\"wp-block-heading\" id=\"h-kako-promatramo-gradu-proteina\">Kako promatramo gra\u0111u proteina?<\/h2>\n\n\n\n<p id=\"h-za-tocno-razumijevanje-funkcije-proteina-vazno-je-poznavati-njegovu-strukturu-na-atomskoj-razini-da-bi-saznali-izgled-proteina-mozemo-koristiti-rengensku-kristalografiju-koristeci-tu-metodu-mozemo-tocno-pratiti-proteine-kako-se-ponasaju-unutar-stanice-na-taj-nacin-je-zamijeceno-da-se-mutyh-veze-za-dna-i-trazi-mjesto-gdje-je-krivo-sparen-adenin-i-8-oksogvanin-izgleda-da-mu-u-toj-potrazi-pomaze-upravo-pcna-na-nacin-da-pcna-oznaci-mjesto-pogresnog-spajanja-i-na-neki-nacin-pozove-mutyh-da-to-popravi-to-bi-objasnilo-zasto-je-popravak-brzi-kada-su-mutyh-i-pcna-u-interakciji-rezultati-ukazuju-na-to-da-kada-je-mutyh-mutiran-ne-moze-se-ispravno-vezati-za-dna-te-u-tom-slucaju-ne-moze-ni-tragati-za-krivo-sparenim-bazama\">Za to\u010dno razumijevanje funkcije proteina va\u017eno je poznavati njegovu strukturu na atomskoj razini. Da bi saznali izgled proteina, mo\u017eemo koristiti rengensku kristalografiju. Koriste\u0107i tu metodu, mo\u017eemo to\u010dno pratiti proteine kako se pona\u0161aju unutar stanice. Na taj na\u010din je zamije\u0107eno da se MUTYH ve\u017ee za DNA i tra\u017ei mjesto gdje je krivo sparen adenin i 8-oksogvanin. Izgleda da mu u toj potrazi poma\u017ee upravo PCNA, na na\u010din da PCNA ozna\u010di mjesto pogre\u0161nog spajanja i na neki na\u010din pozove MUTYH da to popravi. To bi objasnilo za\u0161to je popravak br\u017ei kada su MUTYH i PCNA u interakciji. Rezultati ukazuju na to da kada je MUTYH mutiran, ne mo\u017ee se ispravno vezati za DNA te u tom slu\u010daju ne mo\u017ee ni tragati za krivo sparenim bazama.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Znanstvenici su analizirali trodimenzionalnu strukturu proteina koji ina\u010de sprje\u010dava razvoj kolorektalne polipoze. Gen koji kodira taj protein se naziva MUTYH. Mutacija tog gena uzrokuje nasljednu kolorektalnu polipozu, \u0161to dovodi do razvoja kolorektalnog karcinoma. Kako nastaju mutacije? Unutar stanice nastaju reaktivne vrste kisika koje uzrokuju oksidaciju DNA. DNA se sastoji od baza, a kada jedna od [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":10022,"featured_media":21061697,"comment_status":"open","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_lmt_disableupdate":"","_lmt_disable":"","footnotes":""},"categories":[16347],"tags":[22895,19427,18525,22897,22896,23081,23082,21303],"class_list":["post-21060963","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-genetika","tag-3d-struktura","tag-dna","tag-genetika","tag-kolorektalna-polipoza","tag-kolorektalni-karcinom","tag-mutyh","tag-pcna","tag-proteini"],"modified_by":null,"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/geek.hr\/znanost\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/21060963","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/geek.hr\/znanost\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/geek.hr\/znanost\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/geek.hr\/znanost\/wp-json\/wp\/v2\/users\/10022"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/geek.hr\/znanost\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=21060963"}],"version-history":[{"count":4,"href":"https:\/\/geek.hr\/znanost\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/21060963\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":21061992,"href":"https:\/\/geek.hr\/znanost\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/21060963\/revisions\/21061992"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/geek.hr\/znanost\/wp-json\/wp\/v2\/media\/21061697"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/geek.hr\/znanost\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=21060963"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/geek.hr\/znanost\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=21060963"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/geek.hr\/znanost\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=21060963"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}