U regijama Supsaharske Afrike otkriveno je postojanje nove vrste salmonele. Radi se o vrsti nazvanoj ST313 i izgleda da je izrazito zarazna za čovjeka, a uz to je i otporna na nekoliko uobičajenih antibiotika.
Teške kliničke slike su se do sada većinom manifestirale kod osoba narušenoga imuniteta, kao što su oboljeli od HIV-a, malarije, pothranjenosti ili anemije. Sve do danas nije se shvaćalo da se radi o posve novom patogenu, tako da su se i posljedice pripisivale postojećoj vrsti koja obično uzrokuje dijareju, a odgovornost za visoku stopu smrtnosti i teška klinička stanja prije se pripisivala oslabljenom imunitetu zaraženih osoba nego agresivnosti bakterije. Nedavna su istraživanja ukazala na puno ozbiljniju situaciju i razotkrila sasvim novi evolucijski oblik patogena.
Tim znanstvenika je proučavao primjerke bakterijskog DNA izoliranog iz krvi zaraženih pacijenata sa ozbiljnim simptomima bolesti. Isti su patili od oslabljenog imuniteta uzrokovanog HIV-om, malarijom, pothranjenošću ili su bili anemični. Od tako prikupljenih primjeraka napravljena je visoko kvalitetna referentna genska sekvenca. Zahvaljujući dobivenoj sekvenci omogućena je detaljna analiza genetske razlike između ST313 i manje patogenih sojeva. Rezultati su bili zapanjujući.
Analizama se došlo do saznanja da je ST313 izgubio oko 2 % gena koji su inače prisutni u drugim vrstama salmonele. Takvo bi nešto vrlo izvjesno moglo značiti da se ST313 prilagođava jednom specifičnom domaćinu. U ovom slučaju, čovjeku. Naime, postoji povezanost između degradiranih zona genoma ST313 i S. typhi, za koju se zna da je jako dobro prilagođena čovjeku kao domaćinu. Šest od deset degradiranih regija genoma se podudaraju kod dvaju patogena. Da se ne radi o slučajnosti, potvrđuju istraživanja koja ukazuju na bitnu ulogu degradiranih regija u interakciji patogena i ljudskih stanica.
Otkriveno je da se ST313 ne širi kao S. typhimurium, koji cirkulira među životinjama, a do ljudi dolazi preko trovanja hranom, već bi se mogao prenositi prvenstveno sa čovjeka na čovjeka i to umjesto da usvaja mutacije kako bi napredovao, ova bi ih se vrsta mogla rješavati. Nova je vrsta, S. typhimurium, izrazito brzo postala otporna na mnoge antibiotike. Dokazano je da je za takvu otpornost na antibiotike odgovorna usvojena skupina gena. Ti su geni skočili u ST313 preko pomičnog genskog elementa zvanog transpozon i sa sobom donijeli dodatne gene koji čine ST313 još pogubnijim.
Zabrinjava činjenica da je smrtnost uzrokovana infekcijom ove vrste, unatoč liječenju antibioticima na koje nije pokazala otpornost i dalje izrazito visoka.
