Jedna ameba podvojene ličnosti daje biolozima tragove o porijeklu organizama od gljiva do ljudi i uvid u to kako su složeni organizmi evoluirali. “Obično mislimo o protistima (jednostaničnim organizmima) kao o `jednostavnim` i ljudima kao `složenim` bićima- ali genom Naegleriepokazuje nam da je toliko složenosti već nastalo stvarno rano u evoluciji”, rekao je Scott Dawson, docent mikrobiologije na UC Davis.
Dawson je glavni autor rada o analiziranju genoma Naegleria gruberi, objavljenom u ožujku časopisa Cell. Timu je također priključio studente UC DavisaMichaela Cipriana i Jonathana Phama. Dawson je prvotno predložio N. gruberi kao kandidata za sekvencioniranje genoma još u 2004., dok je bio poslijedoktorski istraživač na UC Berkeley.
N. gruberi hrani se u blatu kao ameba, ali kada se hrana smanji ispruži dva bičasta nastavka ili flagellae i brzo otpliva dalje. Ona se također može transformirati u tvrdu, otpornu cistu i čekati bolje uvjete. Većina dosadašnjih nastojanja u sekvencioniranju genoma protozoa usmjerena su na parazitske organizme kao što je parazitski uzročnik malarije.
“Ona besplatno živi i može nam puno reći o počecima života – jer ima gene koji mogu raditi sve te različite stvari”, rekao je Dawson. Analiza pokazuje da N. gruberi ima 15.727 gena koji su kodovi za proteine, u odnosu na oko 23.000 u ljudi. S tim genima, organizam može jesti i razmnožavati se, puzati ili plivati, živjeti sa kisikom ili bez njega te se organizirati iznutra kao što to i ljudska stanica radi.
Ljudsko tijelo sadrži stanice koje mogu puzati, kao što su bijela krvna zrnca, ili koje imaju bičaste nastavke, kao što je sperma – iako nitko nema i jedno i drugo. Dakle, ljudi imaju oba seta gena kao što je imao i jednostavan predak kojeg dijelimo s N. gruberi.
Znanstvenici su usporedili genom N. gruberi sa širokim rasponom ostalih eukariota – organizama koji imaju DNA odvojenu od ostatka stanice uključujući zelene biljke, gljive, ljude i neke jednostanične organizme- te pronašli set od 4 000 gena koji se može pratiti unatrag do jednog pretka prije više milijardi godina. Mnogi od tih gena nemaju poznatu funkciju, rekao je Dawson.
“Postoji mnogo neotkrivene biologije”, rekao je. N. gruberibezopasna je za ljude, ali ima srodnika Naegleria fowleri koji živi u mutnoj vodi i može – rijetko – ući u nos i jesti mozak. Sekvencioniranje je provedeno na U.S. Department of Energy`s Joint Genome Institute u Walnut Creek. Prvi zajednički autori rada objavljenog u Cell bili su Lillian Fritz-Laylin, UC Berkeley i Simon Prochnik, Joint Genome Institute.
StemCell Workstation – Ispod leće mikroskopa radna je stanica za izolaciju stanica! – www.amgmicro.com
